L'AFPC organise son travail d'expertise au travers de commissions spécifiques parmi lesquelles on trouve : 

Commission qualité :

• Spécifications techniques et test  des supports plastiques et de l’encartage
• Corps de règles
• Revue des spécifications de personnalisations
• Profil d’évaluation commun ISO 24789

Commission Sécurité :

• Refonte et validation de la procédure de transport des cartes avec le GIE CB
• Accompagnement du GIE CB dans la migration vers PCI CP.
• Présentation d’une organisation de production « cellule compatible » avec PCI CP

Commission développement durable :

• Coordination des industriels sur l’élaboration du bilan GES (bilan Carbone Obligatoire)
• Adhésion de l’AFPC à l’association BILAN CARBONE®
• Mise en place de systèmes de recyclage des cartes en fin de vie